Se trata de dos notables autógrafos, cuyas signaturas topográficas son ms. 8937 y ms. 8936. Ambos ejemplares tal vez formaron parte de los bienes poseídos por Juan de Espina Velasco, clérigo de linaje cántabro y notable musicólogo (1568-1642). Llegó a poseer en su casa madrileña una notabilísima colección de todo tipo de objetos, en la mejor tradición de los gabinetes de curiosidades, tan estimados en la época. Francisco de Quevedo nos informa de que “fue su casa abreviatura de las maravillas de Europa”.

Codex Madrid I (Ms. 8937)
Es un modelo de tratado técnico, datable en torno a 1492-1497. La intencionalidad del autor resulta evidente gracias a su invocación dirigida a un eventual público:

Léeme, lector, si te deleitas conmigo, porque tales cosas son contadas al mundo poquísimas veces, ya que la paciencia exigida por tal profesión y el afán de averiguar dichas cosas desde un punto de vista nuevo se encuentran en pocos. Venid, hombres, a contemplar los milagros que se descubren en la naturaleza mediante tales estudios. Madrid, Biblioteca Nacional de España, Codex Madrid I, f. 6r.

Codex Madrid II (Ms. 8936):
Es un ejemplo muy característico del tipo de cuaderno de trabajo utilizado por el maestro. Desde el punto de vista de su factura material es un ejemplar facticio, compuesto por dos sectores (A y B) que ofrecen la siguiente datación:

Primera estancia en Milán 1491-1493 sector B
Segunda estancia en Florencia 1503-1505 sector A